工程垫资是合法的。垫资工程的形式有：①全额垫资施工，主要是指在工程建设过程中发包人不向承包人支付任何工程价款，而要等待工程项目建设完毕经竣工验收合格后，方按照约定支付工程价款；②利用工程进度款的不足额支付，造成部分垫资施工；③要求承包人向发包人支付保证金作为工程项目启动资金，保证金在施工过程中根据工程进度返还，造成部分垫资施工；④约定按照形象进度付款，比如约定基础完成开始支付进度款，或结构封顶付至工程价款的一定比例。

如何应对垫资风险：

1、严格审查发包方情况，尤其是针对第一次合作的甲方，一定不能因其表面上的名声而放松警惕，最好是请律师、会计等专业人士对其进行详尽的调查，比如项目资金来源以及到位情况、企业过往项目情况、企业履约能力、社会信誉等，进行综合评估后，再决定是否要垫资施工。

2、要在合同中约定工程款支付担保，合同是明确双方权利义务最有效、最直接的证据，为了避免后续拿不到工程款的风险，在签垫资施工合同时，乙方应尽量主张加入担保条款，有了这层保险，就算甲方事后拖欠工程款，也有法可依，可以依靠诉讼等手段回款。

3、尽量推行施工过程结算，施工过程结算是整个建设工程行业的大势所趋，也是保障施工方权益最有效的方式之一。即便是垫资施工项目，也不要约定等工程全部完工后再支付工程款，只要能推行施工过程结算方式，垫资施工的风险会大幅度降低。

4、注意对垫资利息的约定，司法解释承认了垫资施工的合法性，同时也规定，如果双方没有对利息进行约定的话，那乙方再主张垫资施工的利息，就得不到支持。而垫资施工本来就是自己掏的钱，理应从垫资那一刻开始就享受到利息，因此，乙方一定不要忘了在合同中对垫资利息进行约定。